《洞洞杂货店》是一部治愈系奇幻漫画，讲述了大学刚毕业的失意女孩苏澄在求职受挫后，于老城区巷尾发现一家名为“洞洞”的陈旧杂货铺。铺子里堆满看似普通的物件，实则每一件都承载着微小的魔力——能让人梦见故人的旧闹钟、可以传递无法说出口话语的明信片、会替人保守秘密的玻璃罐。店主是一位戴圆框眼镜的沉默青年，自称“阿洞”，他似乎能看透每个客人心中最隐秘的渴望。苏澄被聘为店员后，逐渐发现阿洞并非凡人，而是被诅咒困在杂货铺里百余年的守店灵，唯有收集足够的“心愿碎片”才能获得自由。在帮助形形色色的顾客找到心灵慰藉的过程中，苏澄不仅治愈了他人，也慢慢抚平了自己内心的创伤，并决心为阿洞解开百年诅咒。
一位失去母亲的少女在杂货店买下旧闹钟，当晚她梦见母亲为她梳头、做早餐，醒来后泪流满面。苏澄发现闹钟的魔力并非创造幻象，而是唤醒记忆中最温暖的角落，让告别变得不再冰冷。
腼腆少年暗恋同桌三年却不敢开口，苏澄推荐了“传声明信片”。少年写下心意寄出，次日同桌红着脸告诉他，自己梦到了他的告白——原来明信片会以梦境形式传递话语，比任何情书都更直击人心。
一位老教授将年轻时的遗憾写成纸条投入玻璃罐，罐子瞬间破碎，碎片化作光点飞散。次日他收到一封来自四十年前的回信——当年错过的那位姑娘其实一直在等他，只是阴差阳错失联至今。
苏澄在杂货铺地下室发现一本泛黄日记，记载了阿洞百年前因阻止邪灵吞噬小镇，而被邪灵诅咒“永世守店、不得离开”。她决定寻找破除诅咒的方法，阿洞却摇头说“离开这里的人，都会忘记我”。
一位流浪歌手在杂货店过夜时，随手弹奏了店里的古董钢琴。琴声响起时，货架上的旧物纷纷发出微光，化为“心愿碎片”涌入阿洞体内。苏澄恍然大悟——收集碎片的关键是“真心实意的快乐”。
苏澄在暴雨夜狼狈地躲进洞洞杂货店，发梢滴水、钱包被偷。阿洞递给她一杯热茶和一条干毛巾，轻声说：“你身上有很深的迷茫，但在迷茫之下，藏着比谁都温柔的勇气。”故事自此开始。